CRISPR Hizmetlerimiz

CRISPR ifadesi, “Clustered Regularly Inter Spaced Palindromic Repeats”, sözcüklerinin bir kısaltmasıdır. Bu sistemin temeli, bakteri ve arkelerin kendi genomlarını virüslerden korumak için kullandığı bir çeşit bağışıklık sistemi mekanizmasına dayanmaktadır. CRISPR dizileri içerisinde, istilacı organizmaların nükleik asitlerini taşıyan bir bellek mevcuttur. Hücreye yabancı bir nükleik asit girdiğinde CRISPR dizilerindeki bu bellek ile karşılaştırılır, eğer benzeme var ise, istilacı nükleik asit crRNA’ların rehberliğinde Cas9 endonukleazı ile kesilir. Bu mekanizmanın farkında olan bilim insanları, Cas9 endonuklezına rehberlik eden rehber RNA’ları yeniden şekillendirerek bir single guide RNA (sgRNA) meydana getirmişlerdir. Hedefli sgRNA eşliğinde de genomun istenilen herhangi bir yerinde editing ve ya gen knockout yapma imkanı bulmuşlardır. Bununla birlikte, CRISPR sistemi %100 spesifikliği olan bir uygulama değildir. Bu yüzden, hedef bölgenin validasyonu ve off-target belirleme işlemleri uygulamanın başarılı olması için kaçınılmazdır.

Bu bağlamda, yeni nesil dizileme (NGS) sistemleri, yüksek verimlilikte ve uygun fiyat avantajı ile CRISPR-Cas9 validasyonu ve off-target belirleme imkanı sağlamaktadır. Özellikle, hedef bölgenin validasyonunda, CRISPR amplikon dizileme işlemi klinik, endüstriyel ve akademik uygulamalarda standart bir yöntem halini almıştır.

FicusBio deneyimli uzman kadrosuyla aşağıdaki CRISPR-tabanlı genom hizmetlerini sunmaktadır.

• Deney dizaynı (setup)
• sgRNA tasarlama
• sgRNA klonlama
• sgRNA sentez
• sgRNA ekzojen uygulama
• CAS9, CPF1 ve diğer endonükleazların seçimi
• Endonükleaz klonlama
• Endonükleaz ekzojen uygulama
• CRISPR konstrakt hazırlama
• CRISPR uygulaması
• CRISPR validasyonu
• off-target analizi
• Akademik düzeyde rapor
• Yüksek kalitede görsel sunum

 

 

En doğru sgRNA dizaynı, sentezi ve klonlanması ile etkin off-target analizi konularında doktoralı ve CRISPR konusunda tecrübe sahibi araştırmacılarımızdan destek alınız!